Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPINO95295 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms