Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP19O94966 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP19O94966 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP19O94966 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP19O94966 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP19O94966 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP19O94966 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP19O94966 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP19O94966 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms