Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIPRLO75663 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms