Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms