Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms