Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DENRO43583 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DENRO43583 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DENRO43583 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DENRO43583 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DENRO43583 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DENRO43583 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DENRO43583 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DENRO43583 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DENRO43583 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DENRO43583 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms