Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNAB3O43448 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms