Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C1W4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C1W4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C1W4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C1W4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1W4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1W4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1W4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1W4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C1W4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C1W4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C1W4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C1W4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C1W4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms