Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B4DXG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B4DXG7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
B4DXG7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
B4DXG7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
B4DXG7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
B4DXG7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B4DXG7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B4DXG7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B4DXG7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms