Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIGD1CA8MV81 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIGD1CA8MV81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms