Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms