Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms