Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3AA6NCI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms