Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLRN2A0PK11 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLRN2A0PK11 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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