Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 GNL3LP1-201ENST00000399458 1643 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 UGT2B7-203ENST00000508661 1633 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AP002884.3-201ENST00000504610 2749 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC134508.1-201ENST00000570082 2977 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 LINC01012-204ENST00000629732 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ATG4A-202ENST00000345734 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC021491.4-201ENST00000620769 2573 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL136087.1-201ENST00000305491 426 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 CSHL1-202ENST00000309894 669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KRTAP20-3-201ENST00000382826 273 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 RFPL3-202ENST00000397468 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MIR1208-201ENST00000408334 73 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL353604.1-201ENST00000413901 596 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 SEMA3B-AS1-201ENST00000421735 338 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MEG8-205ENST00000442197 625 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC090311.1-201ENST00000490739 249 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC084398.1-201ENST00000494902 459 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC126182.2-201ENST00000496098 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 EVX1-AS-201ENST00000517726 480 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC103681.1-201ENST00000531663 423 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC090531.1-201ENST00000547168 923 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC106788.1-202ENST00000548889 1212 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MPHOSPH6-207ENST00000569021 392 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC127521.1-201ENST00000576086 854 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 PHBP20-201ENST00000603694 818 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MZT1P1-201ENST00000603781 246 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL031291.1-201ENST00000641979 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 C11orf57-201ENST00000280352 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC079331.2-201ENST00000623462 2546 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TSSK4-202ENST00000339917 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 FBXO47-201ENST00000378079 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 SLC25A14-201ENST00000218197 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 HNRNPKP2-201ENST00000447355 1390 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AP001020.2-201ENST00000581712 1605 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ZNF615-214ENST00000618049 2284 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 DDX53-201ENST00000327968 3629 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 CRX-207ENST00000613299 4193 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ACSL6-206ENST00000379255 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KCTD16-202ENST00000512467 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 PPIE-201ENST00000324379 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 MIR219A1-201ENST00000362166 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 KRTAP9-7-201ENST00000391354 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL353692.1-201ENST00000405081 755 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 ZRANB2-AS2-202ENST00000413421 826 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AL117350.1-201ENST00000418348 640 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC015977.2-201ENST00000420852 567 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 RPL29P28-201ENST00000421928 472 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 AC019197.1-207ENST00000431341 635 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 LINC01803-201ENST00000438659 613 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 LINC01627-201ENST00000452923 243 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LMO3Q8TAP4 UBE2HP1-201ENST00000517466 360 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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