Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms