Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP16Q9Y5T5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP16Q9Y5T5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms