Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T4

PPP2R2C, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2CQ9Y2T4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP2R2CQ9Y2T4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms