Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms