Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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