Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO3Q9UK99 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms