Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSR3Q9UJK0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSR3Q9UJK0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSR3Q9UJK0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TSR3Q9UJK0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSR3Q9UJK0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSR3Q9UJK0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms