Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms