Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23BQ9NYZ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms