Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VNN3Q9NY84 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms