Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 413.83□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-215ENST00000446031 273 ntTSL 313.24□□□□□ -0.294e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 512.32□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-202ENST00000372792 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FASN-208ENST00000635733 100 ntTSL 510.48□□□□□ -0.734e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.064e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 58.45□□□□□ -1.064e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 MAPK6-208ENST00000560802 552 ntTSL 47.72□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FAR1-202ENST00000524933 818 ntTSL 23.33□□□□□ -1.884e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 MAPK6-202ENST00000558063 583 ntTSL 42.78□□□□□ -1.964e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 MAPK6-206ENST00000560254 574 ntTSL 42.77□□□□□ -1.974e-6■□□□□ 8.4
AATFQ9NY61 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.79□□□□□ -1.482e-7■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.15e-10■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.975e-10■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-10■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 HMGA1-206ENST00000478214 716 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.635e-10■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-10■□□□□ 8.3
AATFQ9NY61 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.81□□□□□ -1.161e-323■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 221.52■■□□□ 1.042e-20■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.054e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-203ENST00000547476 584 ntTSL 414.37□□□□□ -0.114e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-208ENST00000552984 574 ntTSL 414.13□□□□□ -0.154e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-206ENST00000550367 835 ntTSL 311.84□□□□□ -0.514e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 TUBA1B-207ENST00000551324 840 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-9■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2□□□□□ -2.091e-323■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.71e-8■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 228.91■■■□□ 2.221e-8■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.621e-8■□□□□ 8.2
AATFQ9NY61 MFGE8-216ENST00000613965 456 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-14■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-228ENST00000567943 860 ntTSL 330.72■■■□□ 2.511e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)28.16■■■□□ 2.11e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 HAUS3-205ENST00000514395 580 ntTSL 427.4■■□□□ 1.981e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 POLN-213ENST00000515357 2183 ntTSL 225.35■■□□□ 1.651e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.61e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 HAUS3-203ENST00000502440 574 ntTSL 423.63■■□□□ 1.371e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-212ENST00000563513 571 ntTSL 422.59■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-227ENST00000567883 650 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.077e-24■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-24■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-8■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-8■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 322.66■■□□□ 1.221e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-211ENST00000476994 591 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 418.61■□□□□ 0.571e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 218.48■□□□□ 0.551e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-217ENST00000577897 536 ntTSL 416.51■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 8.1
AATFQ9NY61 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)24.17■■□□□ 1.469e-8■□□□□ 8
AATFQ9NY61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.399e-8■□□□□ 8
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