Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5S1Q9NUS5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms