Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms