Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOMER3Q9NSC5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms