Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms