Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B1Q9NRF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms