Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms