Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms