Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP29Q9HBJ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP29Q9HBJ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms