Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNMDQ9H2S6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNMDQ9H2S6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms