Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms