Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4CQ9C0C4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms