Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TINF2Q9BSI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TINF2Q9BSI4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms