Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms