Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKP2Q99959 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKP2Q99959 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms