Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIN2AQ99865 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms