Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSF1Q96T23 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSF1Q96T23 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RSF1Q96T23 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms