Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85AQ96PX6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms