Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OPALINQ96PE5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms