Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALPK3Q96L96 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALPK3Q96L96 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms