Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS2Q96L46 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms