Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms