Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC136Q96JN2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC136Q96JN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms