Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms