Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS3Q969F9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS3Q969F9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms